隨著網站的增加，越來越多的建站系統隨之出現，因為作為一般的SEO人員，并不會編寫網站的后臺程序，網站的建站系統包括：織夢、discuz系統、phpcms、phpwind論壇系統等，這些建站系統都很方便，并且建站方式單一，對于不懂編制基礎的人來說，下載一個建站系統軟件，就可以實現建站的目標，但是有很多建站系統不利于搜索引擎優化，需要完善。
一、開源的建站系統容易被掛黑鏈
大部分人使用的建站系統是網絡資源，那么會有一些黑客利用建站系統是開源的，輕松找到網站的數據庫，修改成他們所需要的內容，但是還有很多站長使用開源系統建站，并不懂得如何修改其中的內容，這就給黑客有機可乘的機會，從而造成了巨大的損失。
二、功能不全
一些建站系統的功能并不能滿足SEO人員的要求，有的建站系統不支持網站模塊的添加，導致用戶體驗下降，這樣的建站系統并不利于網站優化，還有一些進展系統不能符合本身的需要，例如企業網站需要搜索框、網站內容需要添加關鍵詞等而建站系統并不能滿足各種各樣的建站需求。
三、生成的代碼不利于網站優化
人員都應該知道網頁的冗長代碼過多，不利于搜索引擎抓取網站的內容，雖然現在的建站系統不斷在完善，但是還有一些建站系統在生成文章時，會帶有大量的冗長代碼，這樣的建站系統不利于網站優化。
建站系統降低了網站搭建的難度，一定程度上也節約了成本，但是在優化網站時，應該盡量避免有上述問題的建站系統。
